电影《黄克功案件》根据真实事件改编，背景设置在1937年的陕甘宁边区，主要讲述了一宗发生在抗日军政大学中的重大审判案件。该案的主人公是抗日军政大学第六队队长黄克功，他因逼婚未成而导致一名16岁的女青年刘茜丧命，引发了一场备受关注的审判。

黄克功是一位曾经的红军团长，拥有杰出的战斗功绩，但他因这桩案件成为了凶手。而被害者刘茜则是一个年仅16岁的来自太原的女青年，她为了参加革命而前来延安。这起案件的审判对于陕甘宁边区的法院来说是一项极具挑战性的任务，因为涉及到了一位曾经的红军将领。

陕甘宁边区高等法院的院长不在，审判的责任落在了雷经天这位审判长身上。雷经天曾经参与过南昌起义、广州起义和百色起义，他与黄克功一同走过了长征的艰难道路。这次审判让他面临了前所未有的挑战，因为他必须在国内外舆论、学生和百姓的愤怒以及老红军的请求等各种压力下，公正地审判这一案件。

为了应对这一挑战，雷经天采取了公开审理和民主判决的方式。在陕北公学的操场上，超过两千人参与了这场庭审，包括毛泽东、贺子珍、张闻天和胡耀邦等党和国家领导人。审判过程中，有12位群众代表发表了意见，黄克功也进行了辩论。最终，审判庭的五名法官进行了激烈的争辩。

黄克功一直希望得到毛主席的特赦，但最后毛泽东的复信宣读出来，决定不赦免他，支持执行极刑。这一审判案件成为了当时的重大事件，也反映了党的法纪和威信的重要性。